06.11.2006
Hilfsmittel für die Forschung zur DNA-Methylierung
Applied Biosystems führt seine Methyl Primer Express®-Software ein. Das frei erhältliche Softwaretool automatisiert schnell das Design von methylierungsspezifischer PCR oder von Bisulfit-Primern für die Sequenzierung. Neu ist auch der methylSEQr™ Bisulphite Conversion Kit, ein Set mit Reagenzien für eine schnelle Bisulfit-Behandlung. Gemeinsam vereinfachen die Produkte verschiedene Anwendungen wie Bisulfit-Sequenzierung und Fragmentanalyse bei Experimenten zur DNA-Methylierung. Mit diesen Experimenten möchten Forscher einen tieferen Einblick in genetische Grundlagen von komplexen Krankheiten wie Krebs gewinnen.
Es kann zeitaufwendig sein, Versuche zur sequenzspezifischen DNA-Methylierung mit Arbeitsschritten wie unspezifischer Primer-Amplifizierung und Mispriming zu entwickeln. Methyl Primer Express automatisiert die entscheidenden Arbeitsschritte und benötigt weniger als fünf Minuten, um ein hoch qualitatives Sequenzierungs- und PCR-Design zu entwickeln, das nahtlos in die DNA-Sequenzierung und der folgenden Fragmentanalyse übergeht, bei denen Applied Biosystems umfangreiche Produktpalette benutzt wird. Die Software kann kostenlos heruntergeladen werden.
Das methylSEQr Bisulphite Conversion Kit von Applied Biosystems ermöglicht mit Natrium- Bisulfit behandelte DNA-Sequenzen mit Sequenzen unbehandelter genomischer DNA zu vergleichen, indem es ein unkompliziertes Verfahren zur genauen Identifizierung von methylierten Strukturen verwendet. PCR-Produkte, die nach einer Bisulfit-Behandlung erzeugt wurden, können direkt sequenziert oder kloniert und dann sequenziert werden.
Quelle: Applied Biosystems