Shotgun-Metagenomik
Erklärung des Begriffs "Shotgun-Metagenomik"
Die Shotgun-Metagenomik ermöglicht die Sequenzierung der Genome mikrobieller Gemeinschaften ohne vorherige Kultivierung. Komplexe mikrobielle Ökosysteme im menschlichen Körper oder in der Umwelt können so zeitsparend untersucht oder auch neue Organismen entdeckt werden.
Im Gegensatz zur PCR wird kein Referenzgenom benötigt. Allerdings generiert die Shotgun-Metagenomik große Datenmengen, die interpretiert werden müssen.
Werden Informationen über die Lebensfähigkeit eines Organismus, beispielsweise über dessen Präsenz in einer mikrobiellen Gemeinschaft oder die Expression bzw. Funktionalität eines identifizierten Gens, müssen die Ergebnisse gegebenenfalls mit weiteren bioanalytischen Methoden kombiniert werden.